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用python生物信息分析零基础(应用Python处理生物信息数据和作图专题培训班)

时间:2023-06-13 作者: 小编 阅读量: 1 栏目名: 生活百科

根据StackOverflow流量统计,2017年6月,Python第一次成为高收入国家StackOverflow访问量最大的标签,照此发展,到了2018年,Python肯定会成为最受欢迎的标签。在GitHub2017年度报告中,Python超越Java成第二受欢迎语言。中国生物技术网诚邀生物领域科学家在我们的平台上,发表和介绍国内外原创的科研成果。投稿者,请将文章发送至weixin@im.ac.cn。

2017年,也是Python排名又上一个新台阶的一年,在ranked.com的排名中,Python是2017年最受欢迎人工智能编程语言(第二是C)。根据Stack Overflow流量统计,2017年6月,Python第一次成为高收入国家Stack Overflow访问量最大的标签,照此发展,到了2018年,Python肯定会成为最受欢迎的标签。在GitHub 2017年度报告中,Python超越Java成第二受欢迎语言。

近期Python又火了一把,一是我大山东省小学六年级的教材中加入了Python的内容;二是从2018年起,Python也将成为浙江高考的内容之一;三是计算机二级考试加入了Python科目。

虽然我们已无法穿越回小学六年级的课堂,但我们有具备丰富实战经验的中科院博士和301医院临床博士联合打造的应用Python处理生物信息数据和作图培训班。

培训的意义在于帮你跨越从概念到行动这一步。基本的Python编程语法是了解乐高积木的每个元件,拼出什么形状是对生信问题的分析,衔接这两段的是如何去实践。初学者,最困难的是转化想法为代码;进阶后,最困难的是有更好的想法。这些我们都涵盖,如何入门,如何体味Python的强大,如何特异地应用于生信分析。

课程安排

一、Python简介

1. 为什么是Python?

2. 为什么不是Python?

3. Python 2还是Python 3?

4. 安装Anaconda

5. 用什么编辑器编写Python程序

6. 安装Jupyter Notebook

7. Jupyter Notebook的使用

二、Python语言基本语法

1. Python的基本元素:数字、字符串和变量

2. Python容器:列表、元组、字典与集合

3. Python的控制结构

4. Python的模块、包和程序

5. Python中的类和对象

三、Python编程实战

1. 十五道精选练习题助力自主编程

四、Python科学计算和机器学习

1. Python与科学计算:NumPy、SciPy、pandas、statsmodels

2. Python与机器学习:scikit-learn、TensorFlow和Keras

五、Python绘图

1. Python绘图:matplotlib、seaborn和Altair

主讲教师

陈同,博士,2015毕业于中科院遗传与发育生物学研究所,生物信息专业,在Cell Stem Cell,NAR等高水平杂志以第一作者或主要作者发表文章,运营有数万关注度的《生信宝典》微信公众号。

1. Chen Tong*, Hao Ya-Juan*,Zhang Ying*, Li Miao-Miao*, Wang Meng, Han Weifang, Wu Yongsheng, Lv Ying, HaoJie, Wang Libin, Li Ang, Yang Ying, Jin Kang-Xuan, Zhao Xu, Li Yuhuan, PingXiao-Li, Lai Wei-Yi, Wu Li-Gang, Jiang Guibin, Wang Hai-Lin, Sang Lisi, WangXiu-Jie, Yang Yun-Gui, and Zhou Qi. (2015) m6A RNA methylation is regulated bymicroRNAs and promotes reprogramming to pluripotency.Cell Stem Cell16, 289–301 (cover story)

2. Cui Yi*, XiaoZhifeng*, Chen Tong*, Wei Jianshu, Chen Lei, Liu Lijun, Chen Bing,Wang Xiujie, Li Xiaoran, and Dai Jianwu. (2014) The miR-7 identified fromcollagen biomaterial based 3-D cultured cells regulates neural stem celldifferentiation.Stem Cells and Development23, 4:393-405. (*co-first author)

3. Wu Hua-Jun*, MaYing-Ke*, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: aweb-based plant small RNA meta-analysis toolbox.Nucleic AcidsResearch40:W22-W28.

马英克,北大才女,科学院博士,爱荷华博后,任职于中科院基因组所,熟悉二三代测序和网站建设,以第一作者或并列第一作者在NAR、Bioinformatics等发表多篇文章。

Wu Hua-Jun*, Ma Ying-Ke*, ChenTong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNAmeta-analysis toolbox.Nucleic Acids Research40:W22-W28.

助教团队

十余名科学院、清华、北大硕士、博士,轮值讲师和助教,辅助学员学习和矫正教授过程中不足的点。

培训时间

2018-01-20到 2018-01-21 (线下讲解实战)

2018-01-27 到 2018-01-28 (可线上线下同时,照顾不能长时间在北京的朋友)

每天早9点到晚5点,半封闭式教学

报到时间:提前一天或者当天都可以

授课地点

北京市西城区鼓楼明德大厦 (北京市旧鼓楼大街47号院2号)。

课程价格

  1. 1. 原价 3999 /人,

    截止2018-01-05 2399 /

    截止2018-01-13 3199 /

    之后恢复原价3999/ (住宿自行解决,提供培训期间午餐)

  2. 2. 名额有限,每次课程报名满30人后自动关闭报名通道

    3. 提供易汉博基因科技实习机会或工作机会

注意事项*

1. 需自备笔记本电脑,系统不限。课程实践需要会提供云计算平台。

3. 上课期间禁止录音,录像。

4. 成功付款的学员,若临时有紧急事情不能到来的,可申请延期,更换后续培训班;也可申请退款。

5. 若开课2周 (含) 前申请退款可退还85%费用;开课3个工作日 (含) 前申请退款退还70%的费用。

6. 不可先延期再退款。

中国生物技术网诚邀生物领域科学家在我们的平台上,发表和介绍国内外原创的科研成果。

注:国内为原创研究成果或评论、综述,国际为在线发表一个月内的最新成果或综述,字数500字以上,并请提供至少一张图片。投稿者,请将文章发送至weixin@im.ac.cn

本公众号由中国科学院微生物研究所信息中心承办

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