青岛市和福建省国家税务局已明确表示，对未按规定规范使用编码的纳税人，主管国税机关将依法进行处理。如果编码选择不符合规定，将会面临处罚风险。
一、编码要求
根据《国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点有关税收征收管理事项的公告》（国家税务总局公告2016年第23号），自2016年5月1日起，纳入新系统推行范围的试点纳税人及新办增值税纳税人，应使用新系统选择相应的编码开具增值税发票。
青岛市和福建省国家税务局已明确表示，对未按规定规范使用编码的纳税人，主管国税机关将依法进行处理。
三、实务操作
1、纳税人在开具发票时，一定要正确选择税收编码，要保证所选税收编码与实际业务的税目和计税方法相符。
比如，A超市销售20斤胡萝卜给B酒店，金额40元，A超市开票时应选择编码为「1010112010000000000」。
编码中各位数字代表的含义为：
1：货物
01：农林牧副渔业类产品
01：农业产品
12：蔬菜及食用菌
01：萝卜等根菜类蔬菜
根据《财政部、国家税务总局关于免征蔬菜流通环节增值税有关问题的通知》（财税〔2011〕137号）的规定，流通环节的蔬菜免征增值税，A超市在履行免税备案手续后，可以向B酒店开具免税的普通发票。
2、《商品和服务税收分类与编码》共计4140项末级编码，实现了增值税征收范围的全覆盖，对应2.8万个统计局的产品和劳务，基本可以满足所有纳税人的开票需求。
3、关于品名的选择，有两个方案，一是直接使用编码对应的默认品名，如上例中的「萝卜等根菜类蔬菜」；二是根据业务实质和行业惯例自行定义，如上例中可自定义为「萝卜」。
4、金税三期监控的信息来源是税收编码，也就是说，发票开具之后，税务机关就可以实时知道销售方向购买方销售了税收编码对应的货物或服务。如果编码选择不符合规定，将会面临处罚风险。
5、编码选择是否符合规定，税务机关检查的方法有两个，一是智能匹配助手，二是人工复核。检查的内容包括，是否使用编码开票，编码选择与业务实质是否相符，税率或者征收率是否正确等。
最关键的一点是，编码是税务机关判定纳税人进销项是否匹配的重要依据。
6、由于现行的发票版式上不显示税收编码，对受票方而言，发票的品名就至关重要了。建议对于金额较大，且构成纳税人直接成本的费用，要注意在合同中约定开票编码、开票品名、计税方法、税率等；对于其他成本费用，应要求对方开具时尽量明细、具体，不要含混不清。
如上例中的B酒店，买的是萝卜，如果A超市开票品名是「蔬菜」、「食品」、「农产品」均不应当接受。
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