此次皇帝所受的打击主要是精神和心理层面的。玄清冲入殿中阻止，并主动请战。此举恰恰坐实了两人之间不清白。并被皇帝要求用药粉杀死摩格，而孩子要留在宫中作为人质。甄嬛本欲自饮毒酒，不料被玄清换了酒杯，毒发身亡。而叶澜依操纵金钱豹在玄凌生辰当天重伤了他，致使他昏迷半月，并虚弱半年之久，之后身体也日渐衰弱。而借由他的重伤，早已掌控了太医院的卫临不断在药物中做手脚。
《甄嬛传》的故事以先帝驾崩，新帝登基为结局。甄嬛成为唯一的太后，又在新帝的明示暗示之下将亲子过继到了儿子的亲生父亲果郡王允礼（小说中的清河王玄清）名下，承继后嗣供奉香火。后续的故事是新帝和他的后宫，是如懿的故事，而不再是甄嬛的故事，也不再是先帝的后宫。而电视剧中被丹药摧毁身体，又因为叶澜依私藏的一颗丹药而断送了生命的皇帝的结局，早已有多处暗示。
当安陵容以身孕救父亲的时候，甄嬛不仅在封号上羞辱她，还利用安陵容自己所制作用来邀宠的香料，让皇帝在情动之下用自己的身体杀死了他和安陵容的孩子。此次皇帝所受的打击主要是精神和心理层面的。实际上在此之前，也就是甄嬛出宫的第三年的六月里选秀中，玄凌得了位新宠傅婉仪。与故去的纯元皇后，总有六七分相似的傅如吟入宫，是皇帝亲口留的牌子。不过一年时间，就从从五品的小仪一跃而成为从三品的婕妤，未有过身孕却就要册为贵嫔。不日册贵嫔，连封妃也是指日可待。
正是因为知道自己虽得宠，却根基不稳，所以在安陵容的挑唆之下，采用五石散争宠，损坏了皇帝的身体，也为皇帝日后身体虚弱留下了病根。而太后震怒，皇帝还在昏迷就已经赐死了傅如吟，甚至牵累傅氏满门。
可能有细心的朋友注意到了，五石散、催情香，都是与药物有关。故事背景的架空王朝——大周朝，乾元帝玄凌的后宫中，连皇帝和皇后的手上也都是红花和麝香的痕迹，或许从一开始就已经注定了玄凌也会在药物上栽跟头，他自己对后宫中这些手段的纵容，潜移默化已经让他的后宫中遍布悲哀。
赫赫（对应电视剧中的准格尔）与大周起了战火，赫赫首领摩格前来觐见，虽然粮草被设计烧了一部分，且不少兵士染了时疫，摩格依旧态度蛮横。摩格向皇帝要求甄嬛和亲。言辞交锋间，在退无可退的境地中，甄嬛选择了妥协，并“自愿”和亲。玄清冲入殿中阻止，并主动请战。此举恰恰坐实了两人之间不清白。一番辩解，暂时打消了皇帝的疑虑，甄嬛却依旧要前去赫赫和亲。并被皇帝要求用药粉杀死摩格，而孩子要留在宫中作为人质。
小说中，淑妃甄嬛称病，实际却是随摩格前往赫赫。夜晚扎营之时，玄清带兵追来，随行的还有甄嬛之妹玉姚。之后玉姚随摩格前往赫赫，并最终成为了摩格的阙氏。而甄嬛要玄清的贴身侍从阿晋送她回宫。玄清之后便驻守边关。玄清与玉隐（浣碧）的书信早已成了他与甄嬛有染的证据。甄嬛本欲自饮毒酒，不料被玄清换了酒杯，毒发身亡。甄嬛从台上跌落，伤了腿，从此之后不能再跳舞。而玄清的死，也成为了泯灭甄嬛心中情的最后一根稻草。
心爱之人逝去，可是活着的人还要继续活下去，她还有家族，有儿女。而叶澜依操纵金钱豹在玄凌生辰当天重伤了他，致使他昏迷半月，并虚弱半年之久，之后身体也日渐衰弱。皇帝的健康受损，不仅给了甄嬛批阅奏折接触朝政的机会，给了她借机在药物中动手脚的机会，更是让她有了在御座之后听政的机会，为新帝登基后她参政奠定了基础。小说中下一任帝王正章帝纾润乃是沈眉庄与温实初之子，皇四子、楚王予润，登基之时当是八岁。
前朝后宫皆在甄嬛掌控之中，乾元三十年时玄凌已然卧病不起了。在知道了他不用已经是太医院院正的卫临，而是用了其他太医，甄嬛察觉出他已然对三皇子予涵（电视剧中的六阿哥弘曕）起了疑心。拿定主意的甄嬛将后宫私通的妃子的香艳事迹绘声绘色的描述给他，刻意刺激他。果然在重重刺激之下，玄凌吐血昏迷。
电视剧中是甄嬛授意卫临配合叶澜依，持续掏空皇帝的身体。实际上小说中的皇帝在被叶澜依重伤之后，越发流连在新入宫的如花一般的宫妃身边，并且为了欢愉而屡次向太医院拿药，拿的自然是避免他力不从心的药物。多年来各种药物的持续作用，他屡次伤恸之下大损心神，加之这一次的重伤，他的身体早已被掏空。也是因为是帝王，一直以来都有整个太医院和天下最好的药材，才维持着健康的表象。而借由他的重伤，早已掌控了太医院的卫临不断在药物中做手脚。
或许正是因为自己的父亲过于偏宠舒贵妃和她所出的六弟，爱屋及乌的偏爱之下甚至没有看到其他儿子，所以玄凌并没有受到过正统的帝王教育。而因为有一个强势而心机深沉的母亲，在她的运作之下，他顺利登基并在短短三年之后就摆脱了权倾朝野的摄政王。他并没有途径学习如何当好一个帝王，更多的是耳濡目染自己母亲的后宫手段。
他相貌极为清俊，于诗词书画等方面造诣颇深，哪怕从不受自己父亲的爱戴，他依旧十分出色。他并没有多大的野心，可是他有帝王的森冷狠绝，更有帝王的负心负情，寡情薄义，除了平生里对纯元皇后朱柔则的一段痴情，余者，他尽皆辜负。因着要显示他的凉薄，他着意辜负的，玄清便着意呵护，桩桩都是他不如玄清。骑射不如，诗情不如，武功不如，勇气不如，宽厚不如，痴情不如，原来皇位本应是玄清的，甄嬛早已心属玄清，他疼若心肝的三个孩子都是玄清的，他才是鸠占鹊巢的那个人。自玄清毫不踌躇地代甄嬛而死，盟友叶澜依骑豹弑帝。而玄凌毫不踌躇的扯过恬嫔、玥贵人挡灾，并射杀叶澜依，本就已经高下判定的两人更成了云泥之别，一为真情，一为假意，于是甄嬛一步步致其于死，无人再对他心生怜悯。
乾元三十年七月十一，玄凌崩于昭阳殿，年四十三，谥曰圣神章武孝皇帝，庙号宪宗。这个与后宫女子爱恨纠缠的男人死在了他的枕边人手中。
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