“从水下第一个生命的萌芽开始……到石器时代的巨型野兽……再到人类第一次直立行走，你已经历许多。现在，开启你最伟大的探索吧：从早期文明的摇篮到浩瀚星宇。”
每一位熟悉《文明6》的玩家都一定知道这句经典的游戏台词，从300万年前的南方古猿到晚期智人，人类究竟是怎样进化而来的呢？
我们的祖先在这三百万年里究竟经历了什么？而要解决这一问题，首先需要用到生物分类学的基础知识，这就不得不提到瑞典的生物学家林奈了。
一、人类的生物学分类
林奈是第一位用系统科学的方法对生物命名的科学家，从林奈之后，生物分类学这一学科被单独开辟出来，现如今共分为：域、界、门、纲、目、科、属、种8类，后者依次从属于前者。
1、现代智人的生物学分类
我们人类属于真核生物域、动物界、脊索动物门、哺乳纲、灵长目、人科、人属、智人种。
图 1 生物学分类
并且在此基础上，可进一步细分出亚门、亚纲、亚目、亚科、亚属、亚种等等。我们人类就属于脊索动物门中的脊椎动物亚门，哺乳纲中的真兽亚纲，灵长目中的类人猿亚目，人科中的人亚科等等。
图 2 现代人类的生物学分类
简而言之，我们现代人类是人科人属人种中的一个（亚）种，学名为晚期智人。
2、其他亚种人类的生物学分类
除晚期智人以外，人类谱系中还有相当多的亚种，已发现的亚种可达几十种，有LD 350-1，纳莱迪人，魯道夫人，能人，格鲁吉亚原人，匠人，豪登人，直立人，先驱人，西布兰诺人，罗德西亚人，海德堡人，尼安德塔人，佛羅勒斯人，吕宋人，澎湖原人，丹尼索瓦人，龍人，長者智人，馬鹿洞人等。
图 3 人属生物分类学分类（图源：inaturalist）
从年代上又可区分为中新世、上新世、更新世三个年代，人类逐渐从始祖地猿、南方古猿进化为能人、直立人、智人。
图 4 人属生物年代分类（图源：inaturalist）
经过长年累月激烈的、优胜劣汰的物种竞争的过程后，人科之下就剩下了少部分类人猿和智人，其他古人类早已消失在历史长河之中，其中黑猩猩与现代人类最为接近，和人类基因组的相似度高达98.8%，在600万年前与人类祖先分化，属于人科-人亚科-黑猩猩属。
图 5 现存人科生物分类学分类（图源：inaturalist）
二、人类的起源
1、单地起源说
目前的主流学说是单地起源说。人类单地起源说主张智人源于非洲，在距今大约5万年到10万年间迁移出非洲，取代了亚洲的直立人和欧洲的尼安德特人。
智人走出非洲时在中东一带与尼安德特人相遇，并发生小规模融合混血，然后才迁移到世界各地，所以非洲以外的现代人都携有部分尼安德特人的基因。 智人往东迁徙在亚洲遇到了丹尼索瓦人，并融合了一部分丹尼索瓦人基因。
2、多地起源说
多地起源说，不同于人类非洲起源说，世界各地对古人类的考古发掘研究给非洲起源说带来了证据的同时，也带来了部分争议和挑战。
目前东亚地区的古人类化石挖掘工作日趋完备，我国已发掘出年代连续的古人类化石，并且发现了距今8万～10万年间的许昌人头盖骨化石，填补了5万年到10万年间的空缺，是一个近乎完整的人类进化系统，并且北京猿人的化石具有许多现代中国人的特征。
目前针对单地起源还是多地起源相关的假说是，究竟是非洲智人移民取代了其他原住民从而形成了现代人类，还是各地古人类的连续独立进化形成了现代人类，还是智人与直立人、尼安德特人等人种的融合同化形成了现代人类。
三、人类的基因
1、人类基因组计划
1985年拟定人类基因组计划的草案；1990年，由多国联合参与的人类基因组计划工程正式启程；1994年中国正式启动人类基因组计划；2000年人类基因组工作草图绘制完成；2003年完成基因组测序工作。
目前基因工程学是科学界的前沿学科，每年都有许多与人类和其他生物基因相关的研究论文发表，后续对人类基因组的解读工作仍是一个浩大的工程，相信未来对人类基因的进一步研究分析能够帮助我们解决从南方古猿到人类进化过程的问题。
2、基因交流现象
2016年有学者在《Nature》发表了一篇研究，其中指出，现代欧洲人大约有1.5%到2.1%的DNA来自尼安德特人，东亚人携带的尼安德特人基因比例比欧洲人高12%至20%，现代人类易患雀斑、抑郁症和烟瘾等，可能都与基因中掺杂了部分尼安德特人的基因片段有关，这一研究侧面印证了智人与尼安德特人存在基因交流。
除此之外，智人还与丹尼索瓦人存在一定程度的基因交流现象。
图 6 智人、尼安德特人、丹尼索瓦人分布（假说）
四、结语
综上所述，我们大抵可以知道，人类从南方古猿到智人的进化过程还是一个扑朔迷离的谜团，尽管现代人类已经有了许多先进的科学技术手段来了解自身、了解祖辈，但我们对人类的了解还不够充分，一个个更具说服力的假说，被相继推翻的过程。
